Деревня Ипатово на речке Харламовке по данным «Списка населенных мест Сибирского края» основана в 1600 году. На сайте Администрации Томского района есть информация: «Под Томском появились заимки, основанные раскольниками, беглыми, ссыльными. Беглые крестьяне селились в вотчине Алексеевского мужского монастыря, ссыльный поп Ипат основал деревню Ипатово (Спасская волость). Среди ссыльных были шведы и поляки».

В списке населенных мест на 1859 г. действительно есть указание на то, что деревня расположена «по правой стороне реки Томи». В деревне 40 дворов, 187 жителей. Деревня Ипатово находится в 22 верстах от г. Томска и в 4 верстах от с. Спасского (Коларово), рядом с дер. Лучаново.

На 1911 г. в деревне Ипатово была молитвенный дом, церковно-приходская школа, одна мелочная лавка. В конце 19 — начале 20 века деревня Ипатово относилась к Спасской волости Томского уезда Томской губернии, а на 1929 г. — к Коларовскому району Томского округа Сибирского края.

Известно также, что в 1948-49 годах лучановский колхоз «Ударник» объединился с колхозом им. Ворошилова соседней деревни Ипатово и появилось укрупненное хозяйство "Вперед к коммунизму».

Источники:
1. Список населенных мест Российский империи. Вып. 60: Томская губерния : список населенных мест по сведениям 1859 года. — СПб., 1868. — С. 15.
2. Памятная книжка Томской губернии 1885 года. — Томск, 1885. — С. 7.
3. Список населенных мест Томской губернии на 1893 год. — Томск, 1893. — С. 44-45.
4. Памятная книжка Томской губернии на 1904 год. — Томск, 1904. — С. 58-59.
5. Список населенных мест Томской губернии на 1911 год. — Томск, 1911. — С. 82-83.
6. Список населенных мест Сибирского края. Т. 2: Округа Северо-Восточной Сибири. — Новосибирск, 1929. — С. 74.