Церковь построена на средства томских купцов, городской казны, а также на капитал, завещанный крестьянином И.В.Виноградовым в одном из густонаселенных районов города.
Вскоре после освящения храма, в 1908 году, было организовано церковно-приходское попечительство.
В ноябре 1909 года при храме было основано общество трезвости во главе с викарным епископом Мелетием. Общество устраивало народыне чтения. и беседы.Прихожан обоего пола числилось 890 чел.
20 августа 1920 года был заключен Договор между Сретенской общиной и Горуездисполкомом о передаче церкви верующим.
На общем собрании 25 января 1925 года община приняла решение войти в литургическое общение с Епископом староканонической ориентации Преосвященным Димитрием (приглашался в храм для богослужений с 1922 года)...
В 1928 году община вслед за архиепископом Димитрием (Беликовым) присоединилась к «григорианцам».
3 марта 1930 года вышло постановление Томского Горсовета о закрытии Сретенской церкви и передаче здания под культурное учреждение. Прихожане перешли в Знаменскую церковь, но продолжали бороться за возвращение храма и неоднократно письменно обращались во ВЦИК.
Здание бывшего храма использовали под склад овощей Томского отделения «Акорта», под ссыпку зерна Поросинского спиртзавода, под Городскую молочную «Молптицепродукта».
10 июня 1934 года принято решение Томского горсовета о разборке здания церкви.
Литература Справочная книга по Томской епархии. Томск, 1914. С. 122.
Безруких Олег, протоиерей. Храмы города Томска.
Опыт церковного историко-археологического исследования : дис. на соискание ученой степени кандидата богословия по кафедре церковной археологии Сергиев Посад. Троице-Сергиева Лавра. 2003. С. 110-112.
